DAP-seq（DNA親和純化測序）

無需特異性抗體，無需轉基因材料，物種不限（動物，植物，微生物），高通量檢測轉錄因子在全基因組的結合位點

藍景科信擁有200+物種，3000+轉錄因子的實驗經(jīng)驗，周期短，口碑好，助力客戶發(fā)表高分文章Cell，Mol Plant，Plant Cell，Plant Physiol，Plant Biotechnol J，J Integr Plant Bio，New Phytol等。

在基因功能組學和表觀遺傳學研究中，轉錄因子結合位點（Transcription Factor Binding Sites, TFBS）的發(fā)掘一直是研究熱點之一。傳統(tǒng)的ChIP-seq（染色質免疫共沉淀測序）方法，在抗體質量很好的情況下能夠有效檢測到TFBS。然而，好的抗體可遇不可求，這限制了ChIP-seq更廣泛的應用。

2016年，O'Malley RC等人在Cell上發(fā)表了使用DAP-seq技術，快速繪制轉錄因子調控靶向DNA區(qū)域圖譜的文章。2017年，Bartlett A等在Nature Protocols上發(fā)表了DAP-seq的實驗方法。DAP-seq技術使TFBS的研究不再局限于任何生物，不再受抗體質量的限制，為生命科學和醫(yī)學領域轉錄因子的研究提供了新型高效的工具。

技術流程

已做物種

植物：

84K楊、桉樹、白菜、白菜型油菜、白樺、白木香、百脈根、稗草、板栗、菠菜、菠蘿、博落回、菜豆、藏紅花、茶樹、大豆、大馬士革黑種草、大麥、大青楊、大葉秦艽、丹參、地錢、冬瓜、冬棗、杜梨、短小蛇根草、二色補血草、番茄、甘薯、甘野菊、甘蔗、柑橘、高加索三葉草、高粱、狗尾草、谷子、海島棉、旱柳、核桃、紅薯、胡蘿卜、花生、黃瓜、黃連、蒺藜苜蓿、角果堿蓬、結縷草、芥藍、金針菇、莖瘤芥、九葉青花椒、菊花、苦蕎、辣椒、藍花耬斗菜、荔枝、蓮、陸地棉、落葉松、馬鈴薯、馬尾松、毛白楊、毛果楊、毛葡萄、毛竹、玫瑰、梅、獼猴桃、棉花、閩楠、牡丹、木薯、擬南芥、歐洲甜櫻桃、蘋果、葡萄、臍橙、茄子、青蒿、青錢柳、楸樹、球等鞭金藻、人參、軟棗獼猴桃、三角褐指藻、桑樹、草莓、山金柑、山桃、杉木、生菜、柿子、疏花水柏枝、栓皮櫟、水稻、酸棗、甜橙、甜瓜、小白菜、夏堇、香椿、香蕉、向日葵、橡膠、小黑楊、小麥、小葉楊、杏、鴨茅、煙草、鹽芥、燕麥、楊梅、楊樹、銀杏、油菜、油松、油桐、玉米、圓葉櫻桃、月季、雜花苜蓿、雜交楓香、棗、芝麻、枳、中帶鼓藻、竹葉花椒、紫菜、紫花苜蓿、紫薇、無患子、717 楊、百合、百歲蘭、伴礦景天、不結球白菜、菜心、滇楊、短芒大麥草、粉葛、鳳梨、甘菊、甘藍、甘藍型油菜、剛毛檉柳、枸杞、光皮樺、黑麥草、胡楊、黃花蒿、黃花棘豆、灰楊、灰氈毛忍冬、集胞藻、藜麥、柳枝稷、龍須菜、麻瘋樹、麻竹、蔓菁、芒果、木荷、歐美楊、歐洲云杉、椪柑、普通煙草、千金子、山新楊、芍藥、司篤克氏棉、苔蘚、桃、甜菜、鐵皮石斛、無花果、西瓜、西葫蘆、橡膠樹、小蘭嶼蝴蝶蘭、小立碗蘚、野大豆、櫻桃、圓果種黃麻、圓柱擬脆桿藻

動物：

驢、飛蝗、新孢子蟲、煙粉虱、草地貪夜蛾、斑點叉尾鮰、綿羊、褐飛虱、斜紋夜蛾、華貴櫛孔扇貝、曼氏血吸蟲、團頭魴、小鼠

真菌：

擬輪枝鐮孢菌、豬苓真菌、意大利青霉、草酸青霉、金黃殼囊孢、靈芝、糙皮側耳、草菇、灰蓋鬼傘、蟲草、亞洲鐮刀菌、蝗綠僵菌、裂殖壺菌、禾谷鐮刀菌、元蘑、疫霉、高盧蜜環(huán)菌、灰霉菌

細菌：

路德維希腸桿菌、嗜熱厭氧桿菌、生氮假單胞菌、布魯氏菌、肺炎克雷伯菌、類球紅細菌、紅桿菌科細菌、成團泛菌、銅綠假單胞菌、伯克霍爾德菌、巴西固氮螺菌、大腸桿菌、根瘤菌、解淀粉芽孢桿菌、美人魚發(fā)光桿菌、膿腫分枝桿菌、殺魚愛德華氏菌、嗜水氣單胞菌

部分轉錄因子家族DAP-seq成功率參考：

注：以上僅供參考，具體轉錄因子成功率以實驗為準。

部分客戶發(fā)表文章：