微生物鑒定與微生物多樣性測序

16S rRNA測序服務(wù)（微生物多樣性研究）

16S rRNA測序是一種擴增子測序，主要用于研究環(huán)境樣品中細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)組成、挖掘樣品之間的差異。相比于傳統(tǒng)的分離培養(yǎng)方法，擴增子測序的優(yōu)點包括：無需分離培養(yǎng)、準(zhǔn)確、快速、靈敏等。

技術(shù)原理

16S rRNA 位于原核細(xì)胞核糖體小亞基上，包括 10個保守區(qū)和9個可變區(qū)，保守區(qū)在細(xì)菌間差異不大，可變區(qū)具有屬或種的特異性，隨親緣關(guān)系不同而存在差異。16S rDNA 非常適用于細(xì)菌系統(tǒng)發(fā)育和分類鑒定的指標(biāo)。16S rDNA 擴增子測序，通常是選擇1-2個可變區(qū)，利用保守區(qū)設(shè)計通用引物進(jìn)行 PCR 擴增，再對可變區(qū)進(jìn)行測序分析和菌種鑒定。16S rDNA 擴增子測序技術(shù)是研究環(huán)境樣品中微生物群落結(jié)構(gòu)組成、挖掘樣品之間差異的重要手段。同理，18S rRNA 和ITS測序分別是針對真核微生物和真菌多樣性研究的分類鑒定手段。

樣本類型

土壤、水體、污泥、腸道物、糞便、皮膚、食品發(fā)酵液等。

技術(shù)路線

• 樣品準(zhǔn)備

• DNA提取與質(zhì)檢

• PCR擴增

• 產(chǎn)物純化

• 文庫制備及庫檢

• 上機測序

• 生信分析

技術(shù)優(yōu)點

• 成本低

• 周期短

• 數(shù)據(jù)準(zhǔn)確

• 結(jié)果靈敏

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